1

發(fā)表期刊：Mol Cancer

影響因子：27.7

發(fā)表時(shí)間：2024年10月21日

背景：癌癥患者更容易受到COVID-19侵襲性病程的影響。開發(fā)識(shí)別COVID-19相關(guān)死亡高風(fēng)險(xiǎn)癌癥患者的生物標(biāo)志物可能有助于確定哪些人需要早期臨床干預(yù)。位于與侵襲性COVID-19風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的基因組區(qū)域中的miRNAs可能代表臨床預(yù)后的潛在生物標(biāo)志物。

結(jié)果：研究發(fā)現(xiàn)miRNAs在CORSAIR（COVID-19 risk-associated genomic regions）中富集。低血漿水平的hsa-miR-150-5p和hsa-miR-93-5p與較高的COVID-19相關(guān)死亡率相關(guān)。hsa-miR-92b-3p水平與SARS-CoV-2檢測(cè)陽(yáng)性相關(guān)。外周血單核細(xì)胞（PBMC）在體外TLR7/8和T細(xì)胞受體（TCR）介導(dǎo)激活后增加了hsa-miR-150-5p、hsa-miR-93-5p和hsa-miR-92b-3p的分泌。在接種第二劑輝瑞-BioNTech COVID-19疫苗后1至9個(gè)月期間，在健康個(gè)體的血清樣本中測(cè)量了這三種miRNA水平的增加。人氣道上皮細(xì)胞的SARS-CoV-2感染影響了其分泌的細(xì)胞外囊泡內(nèi)的miRNA水平。

結(jié)論：MiRNAs在 CORSAIR中富集。血漿miRNA水平可以代表預(yù)測(cè)癌癥患者COVID-19相關(guān)死亡的潛在血液生物標(biāo)志物。

2

發(fā)表期刊：Nat Commun

影響因子：14.7

發(fā)表時(shí)間：2024年10月23日

MicroRNAs（miRNAs）與人類疾病有關(guān)，從癌癥到傳染病。用小分子靶向miRNAs或其靶基因?yàn)檎{(diào)節(jié)與疾病相關(guān)的失調(diào)細(xì)胞過(guò)程提供了機(jī)會(huì)。然而，由于小分子-miRNA數(shù)據(jù)集的規(guī)模較小，預(yù)測(cè)與miRNAs相關(guān)的小分子仍然具有挑戰(zhàn)性。本研究開發(fā)了一個(gè)通用深度學(xué)習(xí)框架sChemNET，用于根據(jù)化學(xué)結(jié)構(gòu)和序列信息預(yù)測(cè)影響miRNA生物活性的小分子。sChemNET通過(guò)一個(gè)目標(biāo)函數(shù)克服了化學(xué)信息稀疏的限制，該目標(biāo)函數(shù)允許神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)從大量未知的影響miRNAs化學(xué)結(jié)構(gòu)中學(xué)習(xí)化學(xué)空間。研究人員通過(guò)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了預(yù)測(cè)的作用于miR-451或其靶標(biāo)的小分子，并測(cè)試了它們?cè)诎唏R魚胚胎發(fā)生過(guò)程中紅細(xì)胞成熟中的作用。還使用體外和體內(nèi)實(shí)驗(yàn)測(cè)試了靶向miR-181網(wǎng)絡(luò)和其他miRNAs的小分子。本研究證明，該機(jī)器學(xué)習(xí)框架可以預(yù)測(cè)在人類和其他哺乳動(dòng)物生物體中靶向miRNAs或其靶標(biāo)的生物活性小分子。

3

發(fā)表期刊：Blood Cancer J

影響因子：12.9

發(fā)表時(shí)間：2024年10月23日

慢性淋巴細(xì)胞白血?。–LL）的發(fā)生和發(fā)展取決于遺傳異常和免疫抑制微環(huán)境。研究人員已經(jīng)探索了遺傳驅(qū)動(dòng)因素可能導(dǎo)致塑造促腫瘤微環(huán)境的免疫細(xì)胞失調(diào)的可能性。本研究在基于Rag2-/-γc-/-MEC1的異種移植模型中對(duì)白血病進(jìn)展過(guò)程中的編碼和非編碼RNAs（ncRNAs）進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組分析。DLEU2/miR-16位點(diǎn)在白血病小鼠的單核細(xì)胞/巨噬細(xì)胞中被發(fā)現(xiàn)下調(diào)。為了驗(yàn)證該簇在腫瘤免疫微環(huán)境中的作用，研究人員生成了一個(gè)小鼠模型，該模型同時(shí)模擬hTCL1的過(guò)表達(dá)和編碼DLEU2/miR-15a/miR-16-1簇的最小缺失區(qū)（MDR）的種系缺失。該模型提供了一種創(chuàng)新且更快的CLL系統(tǒng)，其中單核細(xì)胞分化和巨噬細(xì)胞極化加劇，T細(xì)胞功能失調(diào)。MDR缺失與小鼠CLL細(xì)胞和免疫細(xì)胞上預(yù)測(cè)的靶蛋白（包括BCL2和PD1/PD-L1）的水平呈負(fù)相關(guān)。miR-15a/miR-16-1與靶蛋白的負(fù)相關(guān)已在患者來(lái)源的免疫細(xì)胞上得到證實(shí)。miR-16-1的強(qiáng)制表達(dá)干擾單核細(xì)胞分化為腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞，表明選定的ncRNAs驅(qū)動(dòng)非惡性免疫細(xì)胞的促腫瘤表型。

4

發(fā)表期刊：J Nanobiotechnology

影響因子：10.6

發(fā)表時(shí)間：2024年10月26日

背景：凋亡囊泡（ApoVs）是由凋亡細(xì)胞釋放的細(xì)胞外囊泡，據(jù)報(bào)道對(duì)炎癥性疾病和組織再生具有巨大的治療潛力。雖然對(duì)間充質(zhì)干細(xì)胞（MSCs）進(jìn)行了廣泛的研究，但對(duì)免疫細(xì)胞來(lái)源的ApoVs的研究仍然有限，特別是關(guān)于巨噬細(xì)胞來(lái)源的ApoVs在牙周炎（PD）中的功能和命運(yùn)。

結(jié)果：本研究證實(shí)了牙齦卟啉單胞菌（Pg）相關(guān)PD中巨噬細(xì)胞凋亡的發(fā)生及其作用。這些發(fā)現(xiàn)揭示了凋亡巨噬細(xì)胞及其衍生的ApoVs在協(xié)調(diào)牙周骨重塑中發(fā)揮的關(guān)鍵作用。通過(guò)測(cè)序技術(shù)可以鑒定這些ApoVs中不同功能性miRNAs的富集。此外，本研究闡明了巨噬細(xì)胞來(lái)源的ApoVs主要遞送miR-143-3p，靶向胰島素樣生長(zhǎng)因子結(jié)合蛋白5（IGFBP5），從而破壞牙周骨穩(wěn)態(tài)。

結(jié)論：本研究揭示了Pg相關(guān)PD中的巨噬細(xì)胞發(fā)生細(xì)胞凋亡并產(chǎn)生富含miR-143-3p的ApoVs以沉默IGFBP5，導(dǎo)致成骨-破骨細(xì)胞平衡的擾動(dòng)和隨之而來(lái)的牙周骨破壞。因此，針對(duì)巨噬細(xì)胞中miR-143-3p的干預(yù)措施或采用細(xì)胞凋亡抑制劑Z-VAD有望成為管理PD的有效治療策略。

5

發(fā)表期刊：Genome Biol

影響因子：10.1

發(fā)表時(shí)間：2024年10月21日

背景：MicroRNAs（miRNAs）是一種轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)基因表達(dá)的小非編碼RNAs。已知血漿miRNA水平的擾動(dòng)會(huì)影響疾病風(fēng)險(xiǎn)，并有可能成為疾病生物標(biāo)志物。探索miRNAs的遺傳調(diào)控可能會(huì)對(duì)它們?cè)诳刂苹虮磉_(dá)和疾病機(jī)制中的重要作用產(chǎn)生新的見解。

結(jié)果：本研究對(duì)參與鹿特丹研究的2178名參與者中的2083個(gè)血漿循環(huán)miRNAs進(jìn)行了全基因組關(guān)聯(lián)研究，以確定miRNA表達(dá)數(shù)量性狀位點(diǎn)（miR-eQTLs）。結(jié)果確定了1289個(gè)SNPs和63個(gè)miRNAs之間的3292個(gè)關(guān)聯(lián)，其中65%在兩個(gè)獨(dú)立的隊(duì)列中被復(fù)制。本研究證明血漿miR-eQTLs與基因表達(dá)、蛋白質(zhì)和代謝物QTL共定位，這有助于識(shí)別miRNA調(diào)節(jié)的通路。研究人員使用UK Biobank數(shù)據(jù)（N=423,419）在全表型組關(guān)聯(lián)研究和孟德爾隨機(jī)化研究中調(diào)查了循環(huán)miRNA水平改變對(duì)各種臨床條件的影響，揭示了幾種miRNAs對(duì)各種臨床狀況的多效性和因果效應(yīng)。在孟德爾隨機(jī)化分析中，研究人員發(fā)現(xiàn)miR-1908-5p對(duì)良性結(jié)腸腫瘤風(fēng)險(xiǎn)的保護(hù)性因果效應(yīng)，并表明這種效應(yīng)與其宿主基因（FADS1）無(wú)關(guān)。

結(jié)論：本研究豐富了我們對(duì)血漿miRNAs遺傳結(jié)構(gòu)的理解，并探討了miRNAs在各種臨床條件下的特征。基于群體的基因組學(xué)、其他組學(xué)層和臨床數(shù)據(jù)的整合為揭示miRNAs的潛在臨床意義提供了機(jī)會(huì)，并為基于miRNA的新型治療靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)提供了工具。